기계의 몸을 얻기 위해 은하철도 999를 타려하는 철이(일본식 이름은 데츠로).. 의문의 여자 메텔의 도움으로 우연히 은하철도999의 티켓을 얻게되고 종착도 모르는 우주여행을 시작하게 된다. 여행중 거치게 되는 여러 별들에서 철이는, 아름다운 별들의 모습 뒤로 가려진 수많은 사람들의 슬픔과 좌절, 고통과 눈물을 보게 된다. 결국 수많은 난관을 헤치고 여행의 끝인 기계인간성에 도달한 철이..그러나 철이는 그곳에서 영원한 생명을 주지만 그것이 실제로는 수많은 인간들의 목숨과 희생 위에서 이루어진다는 것을 알게되고 결국 메텔 행성과 기계